Từ ngày 1/8/2025, doanh nghiệp hoạt động thương mại điện tử, đặc biệt là các đơn vị thường xuyên nhập hàng hóa giá trị nhỏ qua đường chuyển phát nhanh, sẽ chịu tác động trực tiếp từ chính sách thu thuế GTGT tự động mới được triển khai bởi Bộ Tài chính và Tổng cục Hải quan.
Đây là một bước ngoặt lớn trong quản lý hải quan và chính sách thuế, thể hiện nỗ lực siết chặt các hoạt động TMĐT xuyên biên giới, chống thất thu ngân sách, đồng thời thúc đẩy hiện đại hóa ngành logistics.
1. Cơ sở pháp lý: Vì sao lại có thay đổi về chính sách thuế?
Trước đây: Hàng dưới 1 triệu đồng được miễn thuế
Theo Quyết định số 78/2010/QĐ-TTg ngày 30/11/2010, hàng hóa nhập khẩu gửi qua dịch vụ chuyển phát nhanh có giá trị từ 1 triệu đồng trở xuống sẽ được miễn thuế nhập khẩu và thuế GTGT.
Chính sách này được duy trì suốt nhiều năm, thể hiện trong các văn bản hướng dẫn như:
- Thông tư 191/2015/TT-BTC
- Thông tư 56/2019/TT-BTC (sửa đổi bổ sung Thông tư 191)
Do được miễn thuế, các lô hàng giá trị thấp được khai báo trên tờ khai hàng hóa trị giá thấp, không có các chỉ tiêu liên quan đến việc tính thuế và không bị cơ quan Hải quan thu thuế trong quá trình làm thủ tục.
Tuy nhiên: Lỗ hổng bị lợi dụng ngày càng nhiều
Việc miễn thuế GTGT với hàng hóa giá trị nhỏ từng được coi là cơ chế tạo thuận lợi cho TMĐT và các cá nhân nhập hàng lẻ, nhưng thực tế đã nảy sinh nhiều vấn đề:
- Chia nhỏ đơn hàng để né thuế (ví dụ: tách 1 lô hàng lớn thành nhiều kiện nhỏ dưới 1 triệu đồng/lô).
- Hàng hóa lẻ trôi nổi, không có hóa đơn, gây khó cho kiểm soát, thống kê và thu ngân sách.
Trước thực trạng đó, Bộ Tài chính đã quyết định điều chỉnh chính sách thuế, từng bước chuyển từ miễn thuế sang thu thuế GTGT bắt buộc, ngay cả với hàng có giá trị nhỏ.
2. Lộ trình triển khai chính sách thu thuế GTGT tự động
Bước đầu: Thu thủ công (từ 18/2/2025)
Căn cứ theo Quyết định số 01/2025/QĐ-TTg, từ ngày 18/2/2025, các lô hàng dưới 1 triệu đồng nhập khẩu qua chuyển phát nhanh bắt đầu bị thu thuế GTGT theo hình thức thủ công.
Tuy nhiên, việc thu thủ công lại bộc lộ nhiều bất cập:
- Tốn nhân lực xử lý cho cả cơ quan Hải quan và doanh nghiệp chuyển phát.
- Gây chậm trễ trong khâu thông quan và giao hàng.
- Không phù hợp với xu thế số hóa quản lý thuế và logistics hiện đại.
Bước tiếp theo: Thu thuế tự động (từ 1/8/2025)
Để khắc phục, Bộ Tài chính đã sử dụng thủ tục rút gọn để ban hành Thông tư 29/2025/TT-BTC (ngày 26/5/2025), sửa đổi, bổ sung Thông tư 191/2015/TT-BTC và Thông tư 56/2019/TT-BTC, hoàn thiện hệ thống pháp lý và cơ chế tự động tính – thu thuế GTGT ngay tại thời điểm thông quan.
Kế hoạch thực hiện:
- Giai đoạn thí điểm: từ 9/7 đến 31/7/2025, áp dụng với một số doanh nghiệp
- Giai đoạn chính thức: từ 1/8/2025, áp dụng bắt buộc với toàn bộ doanh nghiệp hoạt động trong lĩnh vực chuyển phát nhanh quốc tế (bao gồm đường hàng không, đường bộ, đường sắt)
3. Thông tư 29/2025/TT-BTC có ý nghĩa gì?
Thông tư 29/2025/TT-BTC là công cụ pháp lý quan trọng, nhằm:
- Thúc đẩy chuyển đổi số ngành Hải quan, tích hợp chức năng tính thuế GTGT tự động vào hệ thống khai báo hải quan.
- Ngăn ngừa tình trạng gian lận thuế, chia nhỏ đơn hàng để né thuế.
- Tạo môi trường thương mại minh bạch, đảm bảo công bằng cho các DN tuân thủ đúng quy định.
- Đảm bảo thu đúng, thu đủ thuế GTGT – một nguồn thu quan trọng của ngân sách nhà nước.
Đặc biệt, chính sách mới hướng đến mục tiêu hài hòa giữa quản lý nhà nước và tạo thuận lợi thương mại: kiểm soát được thuế, đồng thời tháo gỡ nhiều vướng mắc về chứng từ cho các DN chuyển phát nhanh và doanh nghiệp TMĐT.
4. Doanh nghiệp TMĐT cần chuẩn bị gì?
Đối với các doanh nghiệp đang hoạt động trên sàn thương mại điện tử (Shopee, Lazada, TikTok Shop, Amazon, Alibaba,…), hoặc các đơn vị làm dịch vụ nhập hàng lẻ, hàng mẫu qua chuyển phát nhanh, cần chủ động chuẩn bị các bước sau để thích ứng chính sách mới:
Tính toán lại chiến lược nhập hàng
- Hạn chế chia nhỏ đơn hàng để né thuế – hành vi này giờ không còn hiệu quả.
- Ưu tiên gom đơn thành kiện lớn để tối ưu chi phí logistics và thủ tục hải quan.
Làm việc với các đơn vị logistics có năng lực khai thuê – nộp thuế
- Chọn đơn vị có hỗ trợ nộp thuế GTGT tự động ngay khi thông quan, giúp tiết kiệm thời gian xử lý.
- Ví dụ: HÙNG ANH 86 hỗ trợ gom hàng – kê khai – nộp thuế GTGT – giao đến tận kho với hóa đơn hợp lệ.
Chuẩn hóa hồ sơ pháp lý
- Hộ kinh doanh hoặc cá nhân TMĐT nên đăng ký mã số thuế cá nhân.
- Các shop bán hàng thường xuyên nên sử dụng hình thức ủy thác nhập khẩu, tận dụng pháp nhân của bên thứ ba để hợp thức hóa hoạt động.
Điều chỉnh chính sách giá bán
- Do hàng hóa nhập khẩu lô nhỏ từ 1/8 sẽ bị cộng thêm 10% thuế GTGT, cần cân nhắc lại mức giá bán để giữ biên lợi nhuận.
Chuẩn hóa nhập khẩu – Chủ động trước chính sách
Chính sách thu thuế GTGT tự động từ 1/8/2025 không chỉ là động thái siết chặt quản lý thuế, mà còn là dấu mốc cho quá trình chuyển đổi số toàn diện ngành logistics và TMĐT.
Đối với doanh nghiệp, đây là cơ hội để tái cấu trúc quy trình nhập khẩu, hợp thức hóa chứng từ, đồng thời xây dựng hoạt động kinh doanh bền vững – minh bạch – hiệu quả hơn.
